Nein, Sperrmengen gibt es keine, du kannst z.B. nirgends festlegen, dass eine gewisse Menge an Waren im Kontor verbleibt.
In den vergangenen ANNOs konnte man das teilweise so lösen, dass man denselben Hafen direkt nochmal anläuft und z.B. 10 Tonnen wieder auslädt. Ob das in ANNO 1800 auch funktioniert, hab ich allerdings noch nicht ausprobiert.
Wenn du das Zeug, das du abholst, auf derselben Insel produzierst, sollte es allerdings auch nicht zu lange dauern, bis der nächste Karren an einem Lagerhaus aufschlägt. Die Zeit, in der also tatächlich nichts im Lager ist, müssten die Bewohner auch mal ne Minute aushalten, ohne gleich zu randalieren...